Som alt andet medicin kan Ibuprofen også give bivirkninger, derfor er det vigtig at læse indlægssedlen, før man benytter sig af pillerne. Den mest almindelige bivirkning er træthed. Herunder er blot opremset nogle af de andre bivirkninger, som kan forekomme: Forstoppelse, kvalme, opkastning. Mavesmerter, blødning fra mave- tarmkanalen, diarré.

For at minimere bivirkninger behandles i så kort tid og med så lav dosis som muligt. I meget sjældne tilfælde kan der opstå pludselig hududslæt, åndedrætsbesvær og bevimelse pga. overfølsomhed (anafylaktisk shock).